一、变相羁押怎么办？
对于公安机关超期羁押的，当事人可以向检察院申诉。对于检察机关超期羁押的，可以向人民监督员申诉，对于法院超期审判可以向检察机关申诉，并均可向上一级公、检、法或人大监督机关申诉，要求撤销或变更强制措施，监督改正。根据自身情况，若不属特殊情况，则属超期羁押行为，确实违法羁押的，可以申请国家赔偿。
二、变相羁押的类型
在刑事诉讼过程中，超期羁押可分为两种类型：
（一）实际意义上的变相羁押主要有：
1、未及时办理延期审批手续导致超期羁押。
2、在刑事拘留后转报劳动教养期间未改变强制措施而导致超期羁押。
3、二审法院对上诉案件迟迟不能宣判而导致超期羁押。
4、案件在刑事诉讼流程的交接过程中导致超期羁押。
5、在案件上报请示或审批阶段出现超期羁押。
（二）变相的超期羁押主要有：
1、不认真执行有关换押制度容易出现超期羁押。
2、办案单位所认定的有别名的犯罪嫌疑人、被告人的姓名与关押的不一致，由于未及时沟通信息而出现超期羁押。
3、由于办案单位与羁押场所在相互衔接工作上出现脱节而导致超期羁押。
三、变相羁押怎么杜绝？
超期羁押，说到底是一个程序违法的问题，程序违法实际上是主观方面的认识以及执法能力和执法水平的问题，所以从根本上解决超期羁押的问题是完全可能的。主要应从以下几方面采取措施：
（一）充分认识变相羁押问题的危害性，转变思想观念。
超期羁押犯罪嫌疑人、被告人不仅影响政法机关执法严肃性，妨害刑事诉讼活动的顺利进行，还严重侵犯了犯罪嫌疑人的合法权益，是造成司法不公的一个重要原因。要进一步提高办案人员对超期羁押的认识，转变思想观念，把严格、公正执法作为各级政法机关的首要任务来抓。政法机关必须进一步端正执法思想，提高办案人员依法办案的自觉性，深入学习刑事诉讼法、行政诉讼法、国家赔偿法等适用法律法规。强化法制观念，增强程序法的意识，杜绝重实体、轻程序的错误思想，对法律高度负责，牢固树立证据意识、时效意识、赔偿意识及人权意识。
（二）加强制度建设，规范执法行为，实现各项执法工作的制度化、正规化。
1、认真实行换押制度，防止超期羁押犯罪嫌疑人、被告人，各级办案机关要认真执行换押制度，尤其是移送单位必须立即将换押证复印件或传真给看守所，接案单位应在接案后三日内及时到看守所换押；
2、对羁押期限实行登记催办制度，准确掌握每一个被羁押人员的诉讼阶段和诉讼期限，将被羁押人员不同诉讼阶段的法律手续和羁押期限进行必要的登记，登记必须及时、准确、详细。催办制度是对即将超期的案件，由看守所催促办案单位及时予以办结或移送的一项制度；
3、建立超期羁押处罚办法，制订《超期羁押追究责任办法》，把超期羁押与各政法机关的执法质量考核挂钩，把依法办案作为各部门年终工作考评的一项重要内容，实行奖惩兑现。
（三）强化监督制约机制，加大执法临督力度。
1、加强各单位及其内部监督。发挥法制、纪检监察和看守所监督制约作用，形成办案部门相互制约机制，杜绝不按规定审批延长羁押期限，防止超期羁押犯罪嫌疑人、被告人。
2、检察机关要加强法律监督，驻所检察室要充分履行监督职能，对超期羁押的发现一件纠正一件，并定期通报，加大法律监督力度。
3、是各单位要对被押的犯罪嫌疑人、被告人实行跟踪监督，并制定催办、纠正超期羁押方面的制度和措施，并与纪检、监察部门协调，从根本上促进办案人员严格依法办案。
（四）加强公、检、法部门的协调配合。
公、检、法各部门进行刑事诉讼活动分工负责，相互配合，相互制约，确保有效地执行法律，保证刑事诉讼活动的顺利进行，共同努力杜绝和根除超期羁押现象，树立政法机关在人民群众中的良好形象，促进社会主义法制建设。
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