法律分析：
员工侵占公款如何处理要看侵占数额的多少。侵占行为侵占行为是否构成犯罪和数额多少有直接的关系，5000元至1万元以上会被以职务侵占罪定罪量刑。原则是上，公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额在5000元至1万元以上的应予追诉。所以，当员工侵占公款达5000元以上的，可以报警处理；如果在5000元以下的，可以协商，拒不退还的，可以起诉要求民事赔偿。
法律依据：
《最高人民检察院、公安部关于经济犯罪案件追诉标准的规定》 第七十五条 公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额在五千元至一万元以上的，应予追诉。
因篇幅问题不能全部显示，请点此查看更多更全内容